Skip to content
Snippets Groups Projects
Commit 7a48b1f7 authored by Liebelife's avatar Liebelife
Browse files

readme

parent 258b00fc
No related branches found
No related tags found
No related merge requests found
......@@ -9,15 +9,25 @@ Pokyny k dotažení potřebných genomů v podobě .fna a doplňkových .gff sou
- .fna soubory obsahují nukleotidové sekvence chromosomů a mitochondriální DNA v podobě multiplefasta souboru. Já pracuji pouze s chromosomy
- .gff soubory obsahují informace o koordinátách jednotlivých typů sekvencí v daných chromosomech (např. exon č.X se vysktuje v chromosomu č.ABC v intervalu 20 až 2300 písmenko)
- data_sample je soubor který ukazuje výslednou podobu po přípravě souborů pro další práci (dogenerování intronů pomocí AGAT tools a intronů pomocí jednoduchého skriptu)
Mus musculus https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/52?genome_assembly_id=992563
Felis catus https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/78?genome_assembly_id=356698
Rattus norvegicus https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/73?genome_assembly_id=1535500
Bos taurus https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/82?genome_assembly_id=371813
Sus scrofa https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/84?genome_assembly_id=317145
Ovis aries https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/83?genome_assembly_id=1549124
Canis lupus familiaris https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/85?genome_assembly_id=984575
Equus caballus https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/145?genome_assembly_id=358900
Ornitohoryhynchus anatinus https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/110?genome_assembly_id=1567774
Monodelphis domestica https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/220?genome_assembly_id=28569
 
Pokyny ke spuštění:
......
0% Loading or .
You are about to add 0 people to the discussion. Proceed with caution.
Finish editing this message first!
Please register or to comment